Gilles Dreyfus se graduó en la Facultad de Medicina de la Universidad de París (Francia) en 1978. Durante su formación médica, trabajó en varios hospitales de Francia, incluidos el Hospital Marie Lannelongue, el Hospital Foch y el Hospital Broussais, donde fue nombrado consultor en 1987. Gilles también fue a Stanford durante 6 meses, con el profesor Shumway, para formarse en trasplantes de corazón.
Trabajó durante casi 10 años con el profesor Alain Carpentier (como cirujano de planta) y, junto con él, desarrolló un programa de trasplante de corazón y LVAD, así como experiencia en reparación de la válvula mitral. Gilles se convirtió en profesor de cirugía cardiovascular en 1989 en la Universidad de París. Se trasladó del Hospital Broussais al Hospital Foch, en París, donde fue nombrado jefe en 1995. Publicó nuevas técnicas para la reparación de la válvula mitral (reposicionamiento del músculo papilar) y utilizó ampliamente la LVAD como puente hacia el trasplante.
El profesor Sir Magdi Yacoub le pidió a Gilles que se uniera a él en 2000 y en 2001 se trasladó como consultor en el Departamento de Cirugía Cardiotorácica del Royal Brompton Hospital y Harefield NHS Trust de Londres y se convirtió en profesor de cirugía cardiotorácica en la Escuela de Medicina del Imperial College de Londres (con una cátedra). También fue director de trasplantes y director de cirugía durante muchos años.
Más recientemente, el profesor Vincent Dor le pidió que asumiera el cargo en 2010 en Mónaco, en el Centro Cardio-Torácico. Actualmente es director médico y sus principales intereses clínicos en la cirugía cardíaca en adultos son la reparación de las válvulas mitral, tricúspide y aórtica, la cirugía del arco aórtico y la cirugía de la insuficiencia cardíaca con el DVI como tratamiento de destino. El Centro se dedicó a la reparación mínimamente invasiva de la válvula mitral tras la adquisición de un robot Da Vinci Xi, y los casos se están realizando con regularidad.
Enseña en un curso llamado Master of Valve Repair, que se celebra regularmente en Mónaco desde 2010 y forma parte del Cónclave Mitral que se celebra cada dos años en Nueva York desde el principio y forma parte del Comité del Programa. Ha sido miembro de la junta directiva de la Sociedad de Válvulas Cardíacas, que celebró su tercera reunión anual en Mónaco, y fue presidente de esta sociedad.